物理学者(ポスドク)による日々の研究生活のメモ書きです ( python/emacs/html/Japascript/シェルスクリプト/TeX/Mac/C言語/Linux/git/tmux/R/ポケモンGO)
GSLをインストールすると、一緒にgsl-histogramというコマンドもインストールされる
■ 使い方 :
もしデータが1列じゃないが、3列目のみのヒストグラムを書きたい場合はawkを使って
実例を示すためにサンプルデータを作る
gnuplotを使ってプロットしてみる
または
この二つを見比べるとboxesは全体を線で囲って箱にしているのに対して、stepsではそれに沿ってステップ関数を描いているだけ(というかまさに名前がそうなんだけど・・・)
問題はヒストグラムは0から5までなのにboxesの方は-0.5から値があるように描かれていること
理想的にはx=0~1の範囲が3、x=1~2の範囲が2、x=2~3の範囲が2、x=3~4の範囲が3、x=4~5の範囲が0のステップ関数になっていて欲しいので、この場合はstepsの方が求めているものに近い
ただ左端と右端(今回は0だからわからないけど)の挙動がなんか思ってるのと違う・・・
そこも縦棒を描いてほしいんだが・・・
しょうがないのでwith boxesの方にオプションを追加してみる
他にも
とかもできる
どういうパターンがあるかは
■ 参考 : gnuplot demo script: fillstyle.dem
■ 参考 : Boxes
同じような塗りつぶしはwith stepsでもできる(最初こっちでやっていて、両端がなんか気に入らなかったので使用をやめた)
やっぱり左端(見えないけど右端も)の扱いがなんか嫌・・・
なので今回はwith boxesのほうを使う
■ 参考 : filling under step functions in gnuplot
まったく関係ないけど、with histepsというのもある(hiは何の略だろう？)
これをwith stepsの代わりに使うとboxesみたいに半ビンだけ左にずれる
(2016/11/30 追記)
一応上記のwith boxes+囲い線のオプションを使えばこんな感じのグラフも作れる
画像検索でのHIT狙いで追記してみた(スクショだからちょっと線の太さが違う)
(2016/12/22 追記)
ずっと書こう書こうと思って、放置してたけど、ついぞ追記・・・
2種類のヒストグラムを重ね書きするときに半透明にするオプションもあります
(データ生成の方法はパス)
これで
あと、上の方のグラフで+0.5とすべきところを-0.5としてたので修正しておきました
ツイート
■ 使い方 :
Usage: gsl-histogram xmin xmax [n]
Computes a histogram of the data on stdin using n bins from xmin to xmax.
If n is unspecified then bins of integer width are used.
要するにComputes a histogram of the data on stdin using n bins from xmin to xmax.
If n is unspecified then bins of integer width are used.
gsl-histogram 0 100 50
で0から100の間を50ビンで区切ってヒストグラムを計算してくれるもしデータが1列じゃないが、3列目のみのヒストグラムを書きたい場合はawkを使って
awk '{print $3}' | gsl-histogram 0 100 50
とかでおk実例を示すためにサンプルデータを作る
# データ作り
%gsl-randist 0 10 rayleigh 2 > hoge.txt
# データの中身はこれ
% cat hoge.txt
0.0454563
3.81005
3.17951
0.65875
3.42053
2.40609
0.589601
1.53702
2.2201
1.55221
# この行でヒストグラムを取っている、0~5を5ビンで分ける
% awk '{print $1}' hoge.txt | gsl-histogram 0 5 5 > hist.txt
# ヒストグラムの中身、1列目がビンの左端の点、2列目がビンの右端の点、3列目がそのビンに入っているサンプル数
# echo 1 | gsl-histogram 0 2 2 とかで確認できる
% cat hist.txt
0 1 3
1 2 2
2 3 2
3 4 3
4 5 0
%gsl-randist 0 10 rayleigh 2 > hoge.txt
# データの中身はこれ
% cat hoge.txt
0.0454563
3.81005
3.17951
0.65875
3.42053
2.40609
0.589601
1.53702
2.2201
1.55221
# この行でヒストグラムを取っている、0~5を5ビンで分ける
% awk '{print $1}' hoge.txt | gsl-histogram 0 5 5 > hist.txt
# ヒストグラムの中身、1列目がビンの左端の点、2列目がビンの右端の点、3列目がそのビンに入っているサンプル数
# echo 1 | gsl-histogram 0 2 2 とかで確認できる
% cat hist.txt
0 1 3
1 2 2
2 3 2
3 4 3
4 5 0
gnuplotを使ってプロットしてみる
# with boxesで描いてみる
# with boxesは省略不能
plot [-1:5][0:4] "hist.txt" u 1:3 with boxes
# with boxesは省略不能
plot [-1:5][0:4] "hist.txt" u 1:3 with boxes
または# with stepsで描いてみる
# with stと省略可能
plot [-1:5][0:4] "hist.txt" u 1:3 with st
# with stと省略可能
plot [-1:5][0:4] "hist.txt" u 1:3 with st
この二つを見比べるとboxesは全体を線で囲って箱にしているのに対して、stepsではそれに沿ってステップ関数を描いているだけ(というかまさに名前がそうなんだけど・・・)問題はヒストグラムは0から5までなのにboxesの方は-0.5から値があるように描かれていること
理想的にはx=0~1の範囲が3、x=1~2の範囲が2、x=2~3の範囲が2、x=3~4の範囲が3、x=4~5の範囲が0のステップ関数になっていて欲しいので、この場合はstepsの方が求めているものに近い
ただ左端と右端(今回は0だからわからないけど)の挙動がなんか思ってるのと違う・・・
そこも縦棒を描いてほしいんだが・・・
しょうがないのでwith boxesの方にオプションを追加してみる
plot [0:5][0:4] "hist.txt" u ($1+0.5):3 with boxes fs solid 0.25 lc 6 lw 3
他にもplot [0:5][0:4] "hist.txt" u ($1+0.5):3 with boxes fill pattern 4 lc 6
とかもできるどういうパターンがあるかは
set term pnt
set output "hoge.png"
test
で確認できるset output "hoge.png"
test
■ 参考 : gnuplot demo script: fillstyle.dem■ 参考 : Boxes
同じような塗りつぶしはwith stepsでもできる(最初こっちでやっていて、両端がなんか気に入らなかったので使用をやめた)
plot [-1:5][0:4] "hist.txt" u 1:3 with fillsteps fs solid 0.25 noborder ls 7, "" u 1:3 with steps ls 7 lw 3
やっぱり左端(見えないけど右端も)の扱いがなんか嫌・・・なので今回はwith boxesのほうを使う
■ 参考 : filling under step functions in gnuplot
まったく関係ないけど、with histepsというのもある(hiは何の略だろう？)
これをwith stepsの代わりに使うとboxesみたいに半ビンだけ左にずれる
plot [-1:5][0:4] "hist.txt" u 1:3 with fillsteps fs solid 0.25 noborder ls 7, "" u 1:3 with histeps ls 7 lw 3
(2016/11/30 追記)
一応上記のwith boxes+囲い線のオプションを使えばこんな感じのグラフも作れる
画像検索でのHIT狙いで追記してみた(スクショだからちょっと線の太さが違う)
(2016/12/22 追記)
ずっと書こう書こうと思って、放置してたけど、ついぞ追記・・・
2種類のヒストグラムを重ね書きするときに半透明にするオプションもあります
(データ生成の方法はパス)
set style fill transparent solid 0.15
set term png
set output "hoge.png"
plot [0:20]"hist_2.txt" u ($1+0.5):3 with boxes fs lc 7 lw 3 title "rayleigh 2", "hist_5.txt" u ($1+0.5):3 with boxes fs lc 6 lw 3 title "rayleigh 5"
set term png
set output "hoge.png"
plot [0:20]"hist_2.txt" u ($1+0.5):3 with boxes fs lc 7 lw 3 title "rayleigh 2", "hist_5.txt" u ($1+0.5):3 with boxes fs lc 6 lw 3 title "rayleigh 5"
これで
あと、上の方のグラフで+0.5とすべきところを-0.5としてたので修正しておきました
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ＨＮ：coffee
職業：物理屋（自称）
趣味：映画鑑賞、登山
出身：大阪府の南の田舎
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# 最終更新 2022/10/25
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