物理学者(ポスドク)による日々の研究生活のメモ書きです ( python/emacs/html/Japascript/シェルスクリプト/TeX/Mac/C言語/Linux/git/tmux/R/ポケモンGO)
こんな感じのテキストデータがあって、これを読み込む
■ 過去記事 : Python を用いて実験データを読み込み、可視化する
これで1つのテキストファイルをndarrayに収納はできた
あとは、複数のファイルを読み込んで1つにまとめる
listにしといて、appendを使ったほうが早いのかもしれんけど、とりあえず動いたので良し
(2022/08/7 追記)
このhstackで2つのarrayを結合している
https://deepage.net/features/numpy-stack.html#基本的な結合の仕方
(2023/02/01 追記)
上の例だと、ファイルの通し番号順に上からarrayを作ってくれない
1つ目に開いたファイルの中身がarrayの一番最初に来て欲しい時は・・・
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5 6
みたいな2列のデータを読み込みたい
(2023/06/09 追記)
ある任意の列だけ読み込みたいときは、
np.loadtxt(fname, dtype=str, unpack=Truc, usecols=[0, 2, 3])
のように書く
これで、0, 2, 3列目のみ取り出せる
loadtxtでテキストファイルを読み込むときは、すべての列数が同じことが必要みたいで
通常は5個しか要素がないのに、ある行だけ6個要素があるとエラーになる
必要な列だけ書いて読み込むことで、そのエラーを回避することができる
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2列目のみ解析に使う、2列目のみ使うので1列目は捨てる2 22
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import numpy as np
fname="hoge.txt"
a = (np.loadtxt(fname, unpack=True))[1]
unpackのオプションがなんで必要かはいかの記事を参照fname="hoge.txt"
a = (np.loadtxt(fname, unpack=True))[1]
■ 過去記事 : Python を用いて実験データを読み込み、可視化する
これで1つのテキストファイルをndarrayに収納はできた
あとは、複数のファイルを読み込んで1つにまとめる
import numpy as np
for i in range(100):
fname="hoge%d.txt" % (i)
a = (np.loadtxt(fname, unpack=True))[1]
if i == 0:
b = a
else:
b = np.hstack((b, a))
これでbにすべての結果が入るfor i in range(100):
fname="hoge%d.txt" % (i)
a = (np.loadtxt(fname, unpack=True))[1]
if i == 0:
b = a
else:
b = np.hstack((b, a))
listにしといて、appendを使ったほうが早いのかもしれんけど、とりあえず動いたので良し
(2022/08/7 追記)
このhstackで2つのarrayを結合している
https://deepage.net/features/numpy-stack.html#基本的な結合の仕方
(2023/02/01 追記)
上の例だと、ファイルの通し番号順に上からarrayを作ってくれない
1つ目に開いたファイルの中身がarrayの一番最初に来て欲しい時は・・・
1 2
3 4
5 6
みたいな2列のデータを読み込みたい
for i in range(7, 21):
fname = "hoge%d.txt" % i
# ファイルサイズが0以上かチェック
if os.path.getsize(fname) > 0:
aa, bb = np.loadtxt(fname, unpack=True)
if i == 7:
a = aa
b = bb
else:
a = np.hstack((a, aa))
b = np.hstack((b, bb))
else:
print("error at %s" % fname)
fname = "hoge%d.txt" % i
# ファイルサイズが0以上かチェック
if os.path.getsize(fname) > 0:
aa, bb = np.loadtxt(fname, unpack=True)
if i == 7:
a = aa
b = bb
else:
a = np.hstack((a, aa))
b = np.hstack((b, bb))
else:
print("error at %s" % fname)
(2023/06/09 追記)
ある任意の列だけ読み込みたいときは、
np.loadtxt(fname, dtype=str, unpack=Truc, usecols=[0, 2, 3])
のように書く
これで、0, 2, 3列目のみ取り出せる
loadtxtでテキストファイルを読み込むときは、すべての列数が同じことが必要みたいで
通常は5個しか要素がないのに、ある行だけ6個要素があるとエラーになる
必要な列だけ書いて読み込むことで、そのエラーを回避することができる
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職業：物理屋（自称）
趣味：映画鑑賞、登山
出身：大阪府の南の田舎
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print "先月子供が産まれました！"
# 最終更新 2022/10/25
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