忍者ブログ
物理学者(ポスドク)による日々の研究生活のメモ書きです ( python/emacs/html/Japascript/シェルスクリプト/TeX/Mac/C言語/Linux/git/tmux/R/ポケモンGO)
■ 2つのデータに対してKS検定をする場合
% x=rnorm(10, mean = 1)
% y=rnorm(10, mean = 1)
% x
[1] 0.91430534 1.59262261 1.52565219 1.68065990 2.35755910 1.91386531
[7] -2.26359817 0.08465784 0.06163455 -0.10943752
% y
[1] 2.2200235 2.2241460 1.0733582 0.8002340 1.6228854 0.2652880
[7] 1.4286084 -0.6869875 0.1918104 2.2083442
% ks.test(x, y)

Two-sample Kolmogorov-Smirnov test

data: x and y
D = 0.3, p-value = 0.7869
alternative hypothesis: two-sided


■ 1つのデータに対した正規分布のKS検定をする場合
% x=rnorm(10, mean = 1)
% ks.test(x, pnorm)

One-sample Kolmogorov-Smirnov test

data: x
D = 0.43645, p-value = 0.02996
alternative hypothesis: two-sided

2つの引数は、比較したい分布を指定する文字列、正規分布なら pnorm、ポアソン分布なら ppois、一様分布の場合 punif を指定できる

■ 正規分布の場合だと、平均と分散も指定可能
% ks.test(x=vx,y="pnorm",mean=mean(vx),sd=sd(vx))

One-sample Kolmogorov-Smirnov test

data: vx
D = 0.13793, p-value = 0.9196
alternative hypothesis: two-sided


■ 片側検定/両側検定の切り替えはalternativaで行う
デフォルトでは両側検定になっている
% ks.test(x, y, , alternative="t")

Two-sample Kolmogorov-Smirnov test

data: x and y
D = 0.3, p-value = 0.7869
alternative hypothesis: two-sided

% ks.test(x, y, , alternative="l")

Two-sample Kolmogorov-Smirnov test

data: x and y
D^- = 0.1, p-value = 0.9048
alternative hypothesis: the CDF of x lies below that of y

% ks.test(x, y, , alternative="g")

Two-sample Kolmogorov-Smirnov test

data: x and y
D^+ = 0.3, p-value = 0.4066
alternative hypothesis: the CDF of x lies above that of y



■ 検定結果からp値を取り出したいときは、
結果をなにかに代入して、namesで中身を調べる→ p値のみを取り出す
% out <- ke.test(x, y)
% names(out)
[1] "statistic" "p.value" "alternative" "method" "data.name"
% out$p.value
[1] 0.7869298






PR
この記事にコメントする
Name
Title
Color
E-Mail
URL
Comment
Password   Vodafone絵文字 i-mode絵文字 Ezweb絵文字
プロフィール
HN:coffee
職業:物理屋(自称)
趣味:映画鑑賞、登山
出身:大阪府の南の田舎
自己紹介:
import MyProfile
import coffee_pote from TWITTER
import amazonのほしい物リスト from WISH_LIST

print "先月子供が産まれました!"

# 最終更新 2022/10/25
カウンター
カウンター カウンター
ブログ内検索
ツイートするボタン
リンク
相互リンク募集中です (Twitterにてお知らせください)

Demo scripts for gnuplot version 5
(gnuplotのさまざまなデモ画像と作り方がまとめられている、眺めているだけでできるようになった気分になれる)

gnuplotスクリプトの解説
(米澤進吾さんの個人ページ、gnuplotと言えばこのかた)

gnuplot のページ
(Takeno Lab、うちのブログがリンクされていたのでリンク返し)

Twitterから映画の評価が分かる & 映画の鑑賞記録が残せる coco
(映画の感想をまとめられるサイト、いつもお世話になっています)

Astronomy Picture of the Day Archive
(天文や宇宙関連の最新の話題について画像とともにNASAが説明しているページ)

今日のほしぞら
(任意の時刻の空で見える星を表示してくれる、国立天文台が管理している)

GNUPLOTとアニメーション
(応用の項目の「見せてあげよう!ラピュタの雷を!!」あたりからすごすぎる)

読書メーター
(読んだ本をリストできる便利なサイト)

flickr難民の写真置き場
(20XX年、flickrは有料化の炎に包まれた。あらゆるflickr無料ユーザーは絶滅したかに見えた。 しかし、tumblr移住民は死に絶えてはいなかった。)

教授でもできるMac OS X へのLaTeX, X11, gccのインストレーションと環境設定
(阪大の山中卓さんのwebページ、タイトルにセンスが溢れている、内容は超充実してる、特にTeX関連、学振DCとかPDの申請書類作成時にはお世話になっております)

英語論文執筆用の例文検索サービス
(とんでもないものを見つけてしまった・・・・ arXivに収録されている 811,761報の 英語論文から,例文を検索するための検索エンジン)


Template "simple02" by Emile*Emilie
忍者ブログ [PR]